大连市第三人民医院始建于1951年，当时座落于风景秀丽的星海公园附近。其前身是为适应抗美援朝战争而组建的东北人民政府第六医院管理局旅大医院管理处第十一医院。

因为战伤医院的特殊要求，建院初期未建门诊，是一所拥有840张床位的上肢专科医院。共有卫生技术人员400余人。由于是仓促组建，设备简陋，医疗水平也不高，对因未得到及时包扎而感染坏死的肢体，只能采取简单的截肢手术。此间用向苏联学习的肌骨成形术治疗慢性骨髓炎，取得较满意效果。1953年7月抗美援朝战争结束后，各战伤医院相继撤消，合并各医院的医疗骨干调入医院，医疗队伍得到充实，医院性质遂改为综合性，增设门诊，日门诊量1000人次左右，床位减至600张，内设内、外、妇、儿、眼、口、耳、针灸、皮肤等几个医疗科室。

1956年6月，医院归属地方，改为旅大市卫生学校附属医院，床位减至300张。医院在正常的临床医疗任务外，还承担临床教学任务，各科均成立相应的教研室。1958年增设了预防保健科、麻醉组和中医门诊。此时的医疗水平已得到很大提高。眼科于1957年实施当时在国内属高难度的角膜移植术并获成功；妇产科于1958年初研制出我国第一台人工流产电动吸引器；内科开展了当时尚未普及的弦线式心电图检查，肝脏、脾脏穿刺活检及脑血管造影等先进技术，外科已能熟练地开展二尖瓣狭窄扩张分离，心包切除等心脏手术，药检室在市内率先开展快速检查法。其它科室的技术水平也均有提高。医院的发展进入一个小小的高潮。

然而，一场被严重扩大化了的反右派斗争使医院的发展处于停顿状态。接踵而来的三年自然灾害，又使人们面临饥饿的威胁，治疗由于缺乏营养而引起的浮肿、肝肿大、干瘦、闭经等疾病，成为医院的主要任务。医院还组织医疗队奔赴县、区。

1962年后，渡过灾荒，医院工作重新走向正规。内科开展了中心静脉压力，门静脉压力拟定腹膜透析等析技术，同时由放射线科配合普及了支气管造影，后腹膜充气造形等特殊造影技术，使内科的技术水平及医疗质量迅速提高，名列市内各医院的前茅。外科于1963年成功地为一位肝结核并发胆管大出血的工人进行了右半肝切除术。此间，药剂、检验等医技科室得到进一步充实，还增设了病理室。“文革”前全院拥有400张床，日门诊量达1400人次。职工总数为601人。医疗队伍素质也得到很大提高，有两人被晋升为副教授。

1966年开始了史无前例的“文化大革命”，医院自然也在劫难逃。 医疗秩序混乱，规章制度废除，技术停顿不前。1969年6月，大连医学院南迁遵义，医院脱离卫校，由沙河口区新华街140号迁至位于沙河口区中山路467号的原医学院附属二院院舍，更名为旅大市第三人民医院。“文革”期间，大批医务人员被下放农村走所谓“六·二六”和“五·七”道路。1970年职工总数仅剩349人，医院被迫砍掉了儿科、皮肤科、病理科。

1976年粉碎“四人帮”后，特别是1978年党的十一届三中全会以来，医院重新出现了中兴局面，此间的主要力量着重放在拨乱反正，肃清“左”的流毒，整顿医疗组织，恢复医疗秩序及规章制度，落实知识分子政策等方面，使医疗技术迅速恢复到“文革”前的水平。大批医疗技术骨干陆续调回，恢复了被砍掉的儿科、皮肤科、病理室，并成立了病理科，增设了钴60放疗科、同位素室、仪检科、中医科病房。骨科、眼科于1982年被市里确定为重点专科并分别配置了动物实验室和仪检室，购置了先进的医疗器械。骨科于1978年成功地进行了游离大网膜移植术，香港《大公报》及国外一些电台对此均做过报道。

内科被省卫生厅任命为省肺心病防治协作组副组长单位；腹外科被省卫生厅任命为省胆石症协作组副组长单位，同时也是东北三省胆石症协作组成员和市门脉高压症、胆石症攻关协作组组长单位，眼科是东北三省六市眼科协作组组长单位。

自1977年至1985年的8年间，用国家拨款和自筹资金添置了100余万元的医疗设备。此间还新建了制剂室，污水处理站，锅炉房等共计1972m2的建筑物等均已投入使用。科研方面更是硕果累累，中医科的“鱼鳞汤”获1983年大连市科技成果三等奖，1985年市卫生系统科技成果一等奖， “生发饮”获1983年市卫生系统科技成果二等奖；检验科的“厌氧菌培养箱”获得1984年国家卫生部科技成果乙级奖，眼科的“实验性葡萄膜炎何首乌动物实验的研究”获1985年辽宁省科协三等奖。

根据辽宁省与大连市签定的协议，三院于1986年6月底前将现有占地面积及其建筑归还大连医学院附属二院，由省市各拨款600万元，共1200万元，在市西部地区为三院新建一所现代化的以肿瘤、眼科为重点的医院。

1991年5月，市三院搬迁至大连市甘井子区千山路40号，经过几代人努力目前已成为一所集医疗、科研、教学于一体的综合性三级甲等医院，占地面积约6万平方米，设置床位1000张，有13个科系36个病房，12个医技科室，10个住院医师培训基地，是大连医科大学非直属附属医院。1996年、2002年分别增挂大连肿瘤医院、大连眼科医院牌匾。

医院是社会的一个缩影，它必然与整个国家的命运息息相关，回顾第三人民医院所走过的艰难曲折的历程，可以看到尽管前进的道路并不平坦，但历史总的趋势是前进的，而三院正是在波浪式的前进中得以发展、壮大的。

而今，市三院新外科大楼及门急诊综合楼建设项目已破土动工。放眼未来，前程似锦，相信在施工建设完成后，广大医务人员将会为市民提供更优质的医疗服务。